小脑萎缩可能是遗传性、变性性疾病导致，也可能是因某些急性病程，如急性小脑炎后期及药物中毒等引起。在遗传性疾病中，脊髓小脑变性、Friedreich型共济失调、齿状核红核苍白球路易体萎缩症等可引起小脑萎缩。在变性性疾病中，多系统萎缩小脑型可引起小脑萎缩。缺血、缺氧性疾病，如急性脑梗死、脑出血、一氧化碳中毒等也可以引起小脑萎缩。另外，药物中毒，如苯妥英钠中毒可引起小脑萎缩。炎症性疾病，如急性小脑炎后遗症可导致小脑萎缩。另外，酒精性小脑变性可以导致小脑萎缩，还有神经副肿瘤综合征也可以导致小脑萎缩。高血压、高脂血症、糖尿病、冠心病、酒精等因素可能会诱发小脑萎缩。
引起小脑萎缩可能是由于外伤导致的，还可能是由于患者脑部疾病引起的，例如脑部水肿、脑溢血、脑部血管痉挛、脑缺氧、脑部肿瘤，或者是脑部组织缺血、坏死引起的一种症状。还可能是由于药物或者化学试剂中毒、病毒感染、细菌侵袭等多种原因引起的现象。患者在日常生活中还可能是由于存在发育不良引起，或者遗传学疾病导致的萎缩，应该治疗原发病然后再进行药物帮助治疗，可以配合脑部CT检查来寻找出病因。此外小脑萎缩还可能是由于白质病变，或者是脑血管破裂引起的一种症状，应及早进行治疗、促进病情恢复。
引起小脑萎缩的原因很多，可见于以下情况：1、遗传性，可见于遗传性小脑共济失调、橄榄桥小脑萎缩等疾病。2、脑部长期供血不足如由于脑动脉粥样硬化造成小脑慢性缺血缺氧，逐渐发生小脑萎缩。3、中毒，可以是治疗疾病的药物副作用如治疗癫痫的苯妥英钠，也可以是长期饮酒造成小脑细胞中毒损害继而萎缩。4、脑血管疾病，小脑的出血或者梗死，当血肿或者梗死灶吸收后逐渐被胶原纤维代替引起小脑萎缩。5、感染，病原微生物入侵脑部影响到小脑也可以造成后期的萎缩改变。6、先天发育障碍，女性怀孕期间受到一些外界因素影响如苯、重金属、空气污染、病毒感染等使脑部发育受到影响可导致小脑萎缩。
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